沙漠地区
印度河平原的东南部，从巴哈瓦尔布尔东部到南部的塔尔帕克地区，是典型的沙漠，是塔尔沙漠在巴基斯坦和印度之间的延伸。它与Bahawalpur的Ghaggar河干河床和Sind的Nara东部运河与平原的中央灌溉区分开。沙漠被称为巴哈瓦尔布尔的Cholistan或Rohi沙漠和信德省的Pat或Thar沙漠。沙漠表面是沙丘和沙脊的迷宫。Sind Sagar Doab大部分地区位于Punjab的最西端，在1946年在卡拉巴赫附近的印度河上建造Jinnah堰坝之前，是一片无用的荒原（被称为Thal沙漠）。Thal运河系统弹幕中的水将沙漠的一部分变成了肥沃的耕地。
土壤
巴基斯坦的土壤被归类为pedocal，其中包括高浓度碳酸钙和低有机质含量的干燥土壤。它们是降雨少且不稳定的土地的特征。主要的土壤类别是印度河盆地土壤，山区土壤和沙质沙漠土壤。但是，即使在很小的区域内，土壤的形成方式也使其多样化。这些土壤的质地，化学成分，颜色和有机物含量各不相同。
印度河盆地的土壤大多数是河流沉积的厚冲积层，并且是最近起源的。河道附近的土壤是最近的土壤，质地不同，从沙子到粉壤土和粉质粘土壤土。它们的有机物含量低，被统称为卡德达土壤。在远离河流的地方，朝着粉粒的中部，较旧的冲积土壤（称为“班加尔”）广泛分布。这些土壤质地中等至优良，有机物含量低，在灌溉和施肥条件下生产力高。但是，在某些涝灾地区，这些土壤已盐渍化。强碱性土壤位于一些小的斑块中。在亚湿条件下的山地地区，这些土壤是无钙质的，有机物含量略高。在三角洲，河口土壤盐分过多且贫瘠。
山地土壤既是残留的（即在固定位置形成的）又是被运输的。沿斜坡和荒山地区已形成浅层残留土壤。这些土壤通常是强钙质的，有机物含量低，但是在半湿润条件下，它们的有机物含量会增加。
沙质沙漠土壤覆盖Sind Sagar Doab和西部Balochistan的Cholistan部分。它们包括流动的沙质土壤和粘土质洪泛区土壤。这些包括中等钙质和风积（风积）土壤。
