球虫，复数球虫，（球虫纲），是孢子虫类型的大量原生动物寄生虫中的任何一种。球虫生活在脊椎动物和无脊椎动物中，主要生活在肠壁细胞中。它们会引起球虫病。生命周期的两个主要阶段是被污染的动物排出的自由生存的卵囊（封装的受精卵）和生活在动物体内的寄生子孢子。生殖发生在性和无性两个阶段。重要的属包括等孢子虫，艾美球虫和疟原虫。
