当苏联人在西突厥斯坦掌权时，保证所有民族的平等与发展时，吉尔吉斯斯坦人民于1924年获得了自己的自治区。1926年，吉尔吉斯斯坦升格为自治共和国，1936年成为联邦。苏联共和国内的共和国1953年，柯尔克孜（Kirgiz）SSR通过在苏联中央添加一条白色边界的蓝色横条纹，采用了苏联红色横幅的改良版。吉尔吉斯斯坦于1991年8月31日宣布独立后，它继续使用其苏联国旗直到1992年3月3日。
今天仍然使用的新国旗的背景也是红色的，但是据说这是由吉尔吉斯斯坦民族英雄玛纳斯贵族所举起的国旗衍生的。旗帜的中央是一道黄色的太阳，带有40射线，对应于玛纳斯的追随者和他联合的部落。它的进一步象征性属性是光，贵族和永恒。在那个太阳上是一个红色和黄色的标志，上面有两个交叉的行，每行三行，都在一个环内。这是吉尔吉斯斯坦传统民居（蒙古包）屋顶的风格化视图。很少有吉尔吉斯人住在蒙古包里，但是直到20世纪中叶，大多数游牧民族都在他们旅行的地方建立了蒙古包。这种设计的象征意义很精致：船旗法谈到了生命的起源，时间和空间的统一，吉尔吉斯人的历史，团结以及壁炉和家庭。
