特伦特理事会。
1536年5月，教皇保罗为在曼图亚举行的拟议议会发表了一次公会。他还授权一批枢机主教起草关于教堂内虐待行为的报告。在枢机主教加斯帕洛·孔塔里尼（Gasparo Contarini）的领导下，这个团体谴责了准备不足的牧师的任命，无能的主教的selection选，善意的积累以及宗教秩序的decade废，宣讲和对灵魂的关怀。然而，这份报告落入了新教徒手中，路德（Luther）将其用于对罗马教堂和罗马教皇的暴力袭击。尽管如此，教皇仍按计划举行该理事会，该理事会定于1537年5月23日在曼托瓦举行。保罗无限耐心地寻求克服皇帝，国王，主教和王子的反对，在九年的时间里一次次地推翻并推迟了安理会的开放，但最终成功地由他的立法机关枢机主教乔瓦尼·德尔（Giovanni del）主持了开幕式1545年12月13日，在特伦特山（Monte）。
为了尊重新教徒的欢呼声，皇帝坚持认为该委员会主要限于纪律处分和改革。然而，教皇决定优先考虑教务事项的决定获胜，特伦特委员会在其早期会议上对法典，原始罪恶，称义和圣礼以及改革都作出了法令。由于对瘟疫的恐惧和武装新教徒部队进攻的威胁，教皇于1548年2月接受该委员会移交给博洛尼亚的统治。但皇帝禁止西班牙和德国牧师前往博洛尼亚，而教皇不得不中止该理事会。 1549年9月17日。然而，特伦特议会的第一阶段已经取得了实质性的进步，导致对教会的教义和纪律进行了彻底的改革。
在整个教皇时期，教皇保罗经常拜访教皇国及其他地区的麻烦点。1535年和1537年，他曾在奇维塔韦基亚；1538年在前往尼斯的途中参观了卢卡和皮亚琴察；1540年他的军队破坏科隆纳家族的势力后，他出现在佩鲁贾以安抚这座城市；1543年，他在前往布塞托与皇帝见面的路上参观了博洛尼亚。
